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mNGS及古細(xì)菌DNA檢測應(yīng)用推薦:PCR去污染試劑盒
更新時間:2021-07-15   點擊次數(shù):1193次

描述

在研究和診斷中,PCR是一種檢測DNA是否存在的敏感方法。PCR中使用的聚合酶經(jīng)常被E.coli DNA污染。當(dāng)檢測少量細(xì)菌DNA時,污染的DNA可能導(dǎo)致靈敏度降低和假陽性。其他污染源可能是dNTPs、緩沖體系、引物/探針,以及操作過程中引入的DNA污染。一般來說,對細(xì)菌的檢測和分型采用16S23S rDNA基因保守區(qū)段為靶點的廣譜范圍探針。該方法對細(xì)菌DNA污染非常敏感,而大多數(shù)Master mix和聚合酶中都發(fā)現(xiàn)細(xì)菌DNA的痕跡。當(dāng)使用qPCR檢測或定量少量的細(xì)菌DNA時,污染的E.coli DNA可能會導(dǎo)致假陽性結(jié)果。

 

為了解決這個問題,我們開發(fā)出PCR去污染試劑盒,既能去除Master mix中細(xì)菌DNA污染,又不影響PCR反應(yīng)的靈敏度。此外,該試劑盒無RNase活性。


優(yōu)勢    

 1. 減少背景污染,提高目標(biāo)基因檢測下限;
     2. 不影響PCR檢測靈敏度;
     3. 簡單易用,操作方便。

 應(yīng)用   1. 去除PCRRT-PCRmastermixE.coli內(nèi)源DNA污染及其他DNA污染;
   2. 用于終點PCR和探針依賴的qPCR
   3. 用于細(xì)菌檢測及基因分型;
   4. 用于古細(xì)菌DNA檢測。

組分及特性

dsDNase:雙鏈特異性DNA酶,去除Master mix、引物及探針等的污染DNA;

DTT60℃條件下,能夠不可逆滅活dsDNase,確保模板DNA不被清除。
不降低反應(yīng)靈敏度   DNA污染是高靈敏度應(yīng)用面對的主要問題。這些應(yīng)用,以低豐度DNA為目標(biāo)檢測基因,極易受到污染DNA的干擾。因此,任何影響PCR靈敏度的去除DNA污染的方法,都是不能使用的。

Figure 2. PCR去污染試劑盒處理/未處理的mastermix、510倍梯度稀釋的gDNA和水(NTC)為模板進(jìn)行qPCR檢測。與NTC untreated組相比,NTC decontaminated組在45cycle仍然沒有信號,說明PCR去污染試劑盒能程度去除mastermix中的污染。PCR去污染試劑盒處理前/后數(shù)據(jù)相比,Cq值并沒有明顯改變,說明基本不影響反應(yīng)靈敏度。


訂購信息

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     ArcticZymes Technologies成立于20世紀(jì)80年代后期,總部位于挪威。致力于從海洋生物中識別新的冷適應(yīng)酶,用于分子研究、體外診斷和治療領(lǐng)域。

    上海創(chuàng)凌生物科技有限公司,聚焦細(xì)胞治療、基因治療、類器官研究、mNGS病原微生物檢測等領(lǐng)域,是ArcticZymes Technologies的中國代理。

 


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